تهدف الإدارة العامة للاقتصاديات والسياسات الصحية الوطنية إلى: 

1.  تحديد العوامل المؤثرة على توزيع وتوفير الخدمات الصحية بجودة عالية مع مراعاة الاستخدام الأمثل للموارد في نظام الرعاية الصحي السعودي.

2.  تنفيذ مشاريع وبرامج استراتيجية الرعاية الصحية في المملكة.

3.  صياغة السياسات الوطنية وخطط التنفيذ.

4.  تعزيز الممارسة المهنية للرعاية الصحية في القطاع الصحي العام والخاص.

5.  رفع توصيات ونتائج المشاريع والمبادرات إلى متخذي القرار.